I. Ban Giám đốc

Ông Nguyễn Khắc Pho
- Bí thư Đảng ủy/Giám đốc/Hạt trưởng.
Ông Nguyễn Đình Trung
- Phó Bí thư Đảng ủy/Phó Giám đốc.
II. Phòng Tổ chức - Hành chính
1.Ông Nguyễn Đình Trung
Trưởng phòng.

2. Ông Lê Hồng Doãn
Phó Trưởng Phòng Tổ chức - Hành chính.
III. Phòng Kế hoạch – Tài chính
1. Ông Nguyễn Sỹ Toàn
- Đảng ủy viên/Trưởng phòng.

2. Ông Nguyễn Duy Luân
- Kế toán trưởng.
IV. Phòng Bảo tồn và Hợp tác quốc tế

Ông Nguyễn Văn Trà
- Đảng ủy viên/Trưởng phòng
Ông Lê Hồng Sơn
- Phó Trưởng phòng
V. Phòng Du lịch sinh thái và Giáo dục môi trường
Ông Nguyễn Văn Ngà
- Trưởng phòng.
VI. HẠT KIỂM LÂM RỪNG ĐẶC DỤNG CÔN ĐẢO

Ông Nguyễn Thái Hậu
- Đảng ủy viên/Phó Hạt Trưởng
Võ Rin